Lessons learned from implementing OMOP CDM in Japanese oncology
Deze studie toont de hoge haalbaarheid aan van het converteren van Japanse oncologische elektronische medische dossiergegevens naar het OMOP CDM-formaat voor grootschalig internationaal observationeel onderzoek, ondanks kleine uitdagingen bij het standaardiseren van chirurgische procedures en meetgegevens.
Oorspronkelijk artikel gelicentieerd onder CC BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Dit is een AI-gegenereerde uitleg van het onderstaande artikel. Het is niet geschreven of goedgekeurd door de auteurs. Raadpleeg het oorspronkelijke artikel voor technische nauwkeurigheid. Lees de volledige disclaimer
In het uitgestrekte landschap van de moderne geneeskunde vindt een stille revolutie plaats, niet in de operatiekamer, maar in de digitale archieven van ziekenhuizen. Decennialang hebben artsen vertrouwd op klinische studies om te bewijzen dat een nieuw medicijn werkt, maar deze studies omvatten vaak zorgvuldig geselecteerde patiënten in gecontroleerde omgevingen die niet altijd de rommelige realiteit van het dagelijs leven weerspiegelen. Om te begrijpen hoe behandelingen werkelijk presteren voor de algemene populatie, moeten onderzoekers "real-world data" bestuderen—de miljoenen records die dagelijks worden gegenereerd wanneer mensen artsen bezoeken, diagnoses krijgen en medicatie innemen. De uitdaging is altijd geweest dat elk ziekenhuis deze informatie op een andere manier registreert, met gebruik van eigen unieke codes en formaten, waardoor het bijna onmogelijk is om gegevens van verschillende plaatsen te combineren om het grotere plaatje te zien. Om dit op te lossen, heeft de wereldwijde onderzoeksgemeenschap een universele vertaler voor medische informatie ontwikkeld genaamd het OMOP Common Data Model. Denk aan een standaardtaal die een ziekenhuis in Tokio rechtstreeks laat communiceren met een ziekenhuis in New York, waarbij hun specifieke records worden vertaald naar een gedeeld formaat zodat ze samen geanalyseerd kunnen worden. Deze aanpak belooft de ontdekking van effectieve behandelingen te versnellen en de patiëntenzorg op wereldwijde schaal te verbeteren, maar het vereist een enorme, nauwkeurige inspanning om lokale records om te zetten naar deze nieuwe standaard.
Een team van onderzoekers aan het National Cancer Center Hospital East in Japan begon met de test of dit vertalingsproces zou kunnen werken voor de complexe wereld van de Japanse oncologie. Ze richtten zich op de elektronische medische dossiers van bijna 8.400 patiënten die tussen 2015 en 2022 werden behandeld voor borstkanker. Hun doel was niet om patiënten te behandelen of een nieuw geneesmiddel te ontdekken, maar om te zien of de bestaande digitale records van hun ziekenhuis succesvol getransformeerd konden worden naar het OMOP-formaat en vervolgens gecontroleerd konden worden op nauwkeurigheid met behulp van een gespecialiseerd kwaliteitsdashboard. Dit was een cruciale test omdat, hoewel andere landen er al succesvol grote netwerken van dergelijke gegevens hebben opgebouwd, Japan nog niet had aangetoond dat zijn specifieke medische dossiers geconverteerd en gebruikt konden worden voor internationaal onderzoek. Het team nam de ruwe tekstbestanden die patiëntgeschiedenissen, laboratoriumresultaten en behandeldetails bevatten en begon aan de zware taak om elke term te mappen aan de wereldwijde standaard. Ze moesten ervoor zorgen dat een Japanse diagnosecode voor een specifiek type kanker overeenkwam met het juiste internationale concept, en dat een medicijn dat in Tokio werd voorgeschreven, werd herkend als dezelfde substantie die in Europa of de Verenigde Staten wordt gebruikt.
De resultaten van deze conversie waren grotendeels bemoedigend. De onderzoekers ontdekten dat zij meer dan 80 procent van de klinische informatie over belangrijke gebieden van de patiëntenzorg, inclusief diagnoses, laboratoriumtests en medicatievoorschriften, succesvol konden standaardiseren. Ze verwerkten miljoenen individuele datapunten, waarbij meer dan 39 miljoen laboratoriumtestresultaten en bijna 300.000 recepten naar het nieuwe formaat werden omgezet. Dit bewees dat het Japanse systeem in staat is om deel uit te maken van het wereldwijde netwerk van observationeel onderzoek. Het proces verliep echter niet zonder hindernissen. Het team ontdekte dat chirurgische procedures het moeilijkste gebied waren om te vertalen; hoewel ze de meeste andere gegevens konden mappen, sloten de specifieke termen die voor operaties in hun systeem werden gebruikt niet goed aan bij de internationale standaarden, waardoor dat deel van de gegevens incompleet bleef. Daarnaast kwamen ze gaten tegen in de records, zoals ontbrekende datums voor bepaalde tests of onduidelijke eenheden van meting voor vitale functies zoals bloeddruk, die handmatig moesten worden aangepakt of uitgesloten.
Om de geconverteerde gegevens betrouwbaar te maken, voerden de onderzoekers bijna 2.000 automatische controles uit om de geldigheid en volledigheid ervan te verifiëren. Slechts 24 van deze controles gaven een fout of een probleem aan, een zeer klein fractie die suggereert dat de algehele kwaliteit van de geconverteerde dataset hoog is. De weinige fouten die optraden, hadden voornamelijk betrekking op ontbrekende informatie in specifieke tabellen, zoals details over overlijdens van patiënten of medicijndoseringen, wat het team identificeerde als problemen die opgelost kunnen worden door de conversiesoftware te verfijnen of de bronrecords te verbeteren. De studie benadrukte ook een belangrijke culturele en administratieve barrière: de Japanse overheid gebruikt haar eigen set standaard medische codes die nog niet gekoppeld zijn aan de internationale vocabulaire die door het OMOP-systeem wordt gebruikt. Dit betekent dat elke keer dat een Japans ziekenhuis lid wil worden van dit wereldwijde netwerk, zij handmatig een brug moeten slaan tussen hun lokale codes en de internationale codes, een tijdrovende taak die aanzienlijke menselijke inspanning vereist.
Uiteindelijk bewijst deze studie dat Japanse medische dossiers kunnen worden getransformeerd naar een formaat waarmee ze samen met gegevens uit de rest van de wereld geanalyseerd kunnen worden. Het bevestigt dat de infrastructuur bestaat om grootschalige internationale studies naar de effectiviteit van kankerbehandelingen te ondersteunen met behulp van real-world data uit Japan. Echter, de weg vooruit vereist meer dan alleen technische conversie; het vraagt om een gecoördineerde inspanning om Japanse medische terminologie te koppelen aan wereldwijde standaarden, zodat het vertalingsproces soepeler verloopt en minder afhankelijk is van handmatig werk. Naarmate meer ziekenhuizen in Japan deze methoden adopteren en overheidsinitiatieven zich richten op de nationale standaardisatie van medische gegevens, groeit het potentieel voor Japan om bij te dragen aan een wereldwijd begrip van kankerbehandeling. Het werk dat hier is verricht, dient als een blauwdruk die laat zien dat hoewel de reis naar een verenigde wereldwijde medische database complex is, het geheel zeker mogelijk is, wat de weg vrijmaakt voor toekomstig onderzoek dat patiënten overal ten goede kan komen.
Verdrinkt u in papers in uw vakgebied?
Ontvang dagelijkse digests van de nieuwste papers die bij uw onderzoekswoorden passen — met technische samenvattingen, in uw taal.