Antimicrobial Susceptibility Profiles, Multidrug Resistance Patterns, and MAR Index Analysis of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli Isolated from Poultry and Chicken Handlers in Maiduguri, Northeast Nigeria

Dans les marchés animés du nord-est du Nigéria, où les poulets vivants sont échangés quotidiennement, une bataille silencieuse est menée entre les bactéries et les médicaments censés les arrêter. L'ennemi est un groupe de bactéries appelées Campylobacter, qui vivent naturellement dans l'intestin des oiseaux et peuvent provoquer de graves maladies stomacales chez les humains qui consomment de la volaille mal cuite ou manipulent des oiseaux infectés. Depuis des décennies, les éleveurs utilisent des antibiotiques pour maintenir leurs troupeaux en bonne santé et les aider à croître plus rapidement. Cependant, lorsque ces médicaments sont utilisés trop souvent ou sans prescription médicale, les bactéries apprennent à survivre face à eux. Cette capacité de survie est appelée résistance aux antimicrobiens. Il s'agit d'une crise mondiale croissante car, lorsque les bactéries deviennent résistantes, les médicaments qui guérissent habituellement les infections humaines cessent de fonctionner. Dans de nombreuses parties du monde, les scientifiques ont constaté que les bactéries issues de la volaille deviennent plus difficiles à traiter, mais dans les régions reculées et touchées par les conflits du nord-est du Nigéria, il n'y avait presque aucune information sur ce que faisaient ces bactéries ou sur la façon dont elles changeaient.

Une équipe de chercheurs s'est donné pour mission de combler cette lacune de connaissances à Maiduguri, une grande ville de l'État de Borno. Ils ont visité six marchés de volaille vivante pour collecter des échantillons provenant des oiseaux et des mains des personnes qui les vendaient. Leur objectif était simple : voir quels antibiotiques pouvaient encore tuer les bactéries et lesquels elles avaient appris à ignorer. Ils ont testé quarante-neuf échantillons confirmés de la bactérie contre dix antibiotiques différents, couramment utilisés en médecine et en agriculture. Ils ont également recherché des instructions génétiques spécifiques à l'intérieur des bactéries qui leur permettaient de résister à certains médicaments, et ils ont calculé un score pour déterminer si les bactéries provenaient d'un environnement où les antibiotiques étaient utilisés massivement.

Les résultats ont brossé un tableau clair et préoccupant de la situation sur le terrain. Les bactéries ont montré la plus forte résistance à la tétracycline, un antibiotique courant utilisé en agriculture. Plus d'un tiers des bactéries collectées étaient capables de survivre à l'exposition à ce médicament. La résistance à un autre médicament, la norfloxacine, était également significative, affectant près d'un quart des échantillons. Cependant, l'étude a trouvé une lueur d'espoir sous la forme de trois autres antibiotiques : la ciprofloxacine, la lévofloxacine et l'érythromycine. Chaque échantillon de bactérie testé était encore vulnérable à ces médicaments, ce qui signifie qu'ils pouvaient encore être utilisés efficacement pour traiter les infections dans cette région. C'est une découverte cruciale car l'érythromycine est souvent le premier choix pour traiter les infections stomacales sévères chez l'homme, et son efficacité ici suggère que les traitements les plus importants restent disponibles.

Malgré les bonnes nouvelles concernant ces trois médicaments, le schéma global de résistance était complexe. Les chercheurs ont constaté que plus de la moitié des échantillons de bactéries étaient multirésistants, ce qui signifie qu'elles avaient appris à survivre à au moins un médicament appartenant à trois familles différentes d'antibiotiques. Il ne s'agit pas seulement du cas d'un seul microbe résistant à une seule pilule ; c'est le signe que les bactéries ont été exposées à une grande variété de médicaments. Pour comprendre d'où venaient ces bactéries coriaces, les scientifiques ont calculé un score de résistance pour chaque échantillon. Un score élevé indique que les bactéries proviennent probablement d'un environnement où les antibiotiques sont utilisés fréquemment et sans contrôle strict. Dans cette étude, les scores étaient élevés, confirmant que les bactéries de ces marchés vivent dans un monde saturé par la pression des antibiotiques.

L'enquête est allée plus loin que le simple test de la réaction des bactéries aux médicaments dans une boîte de Pétri en laboratoire. Les chercheurs ont utilisé des outils moléculaires pour trouver les codes génétiques spécifiques qui permettaient aux bactéries de résister à la tétracycline et à l'érythromycine. Ils ont trouvé le gène responsable de la résistance à la tétracycline dans les bactéries, ce qui correspondait aux taux élevés de résistance observés lors des tests en laboratoire. Ils ont également trouvé le gène de la résistance à l'érythromycine, même si les bactéries semblaient toujours être tuées par le médicament en laboratoire. Cela suggère que les bactéries transportent les instructions cachées de la résistance, attendant les conditions propices pour devenir pleinement actives. Cette découverte est importante car elle signifie que le potentiel d'un échec thérapeutique total est déjà présent, même si les médicaments fonctionnent encore pour le moment.

L'étude conclut que la situation dans les marchés de volaille vivante de Maiduguri est une préoccupation de santé publique qui nécessite une attention immédiate. Le taux élevé de bactéries capables de résister à plusieurs médicaments, combiné à la présence de gènes de résistance, signale que l'utilisation actuelle des antibiotiques dans l'aviculture n'est pas durable. Les chercheurs recommandent que l'accès aux antibiotiques pour les animaux d'élevage soit strictement contrôlé et que les éleveurs soient sensibilisés à l'utilisation responsable de ces médicaments. Bien que l'efficacité actuelle de la ciprofloxacine, de la lévofloxacine et de l'érythromycine offre une fenêtre d'opportunité pour traiter les infections humaines, l'étude avertit que cette fenêtre pourrait se refermer rapidement si le mauvais usage des antibiotiques se poursuit. Les conclusions constituent un appel urgent à l'action pour surveiller de près ces bactéries et pour changer la gestion des antibiotiques afin de prévenir la propagation d'infections incurables de la ferme à la population humaine.