One Health meta-analysis of pooled prevalence of Salmonella Typhi and high-priority strains in Nigeria and systematic review of alternative therapeutics
Cette méta-analyse et revue systématique révèle que *Salmonella* Typhi persiste largement à travers les niches humaines, alimentaires, environnementales et de l'élevage au Nigeria avec des taux élevés de résistance aux fluoroquinolones et aux céphalosporines de troisième génération, particulièrement dans les réservoirs environnementaux et les aliments d'origine végétale, soulignant la nécessité urgente de développer et d'adopter des alternatives thérapeutiques non antibiotiques.
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La fièvre typhoïde est une maladie grave qui se propage lorsque les gens consomment de la nourriture ou de l'eau contaminées par des déchets humains. Elle est causée par un type spécifique de bactérie appelée Salmonella Typhi, qui envahit le corps et provoque de fortes fièvres, de graves douleurs abdominales et de la faiblesse. Contrairement à beaucoup d'autres bactéries qui peuvent vivre chez les animaux, ce germe particulier vit presque exclusivement chez l'homme. Cependant, il ne reste pas dans le corps humain pour toujours ; il est évacué par les excréments et peut facilement contaminer le sol, les rivières et les cultures qui nous entourent. Cela crée un cycle où la bactérie passe d'une personne malade vers l'environnement, puis revient vers une autre personne qui mange ou boit quelque chose de souillé. Dans de nombreuses parties du monde, surtout là où l'accès à l'eau propre et aux systèmes d'assainissement fait défaut, ce cycle est difficile à briser. La situation est aggravée par un problème croissant : la bactérie devient plus difficile à tuer avec les médicaments standards. Les médecins constatent que les médicaments autrefois utilisés pour guérir cette fièvre ne fonctionnent plus aussi bien, les obligeant à utiliser des traitements plus forts, plus coûteux ou moins disponibles.
Une équipe de chercheurs s'est donné pour mission de comprendre toute l'ampleur de ce problème au Nigeria, un pays où la maladie est très courante. Ils ne se sont pas contentés d'étudier les personnes malades dans les hôpitaux ; ils ont plutôt adopté une approche « One Health » (Une seule santé), ce qui signifie qu'ils ont étudié la bactérie partout où elle pouvait exister : dans l'être humain, dans la nourriture que nous mangeons, dans l'eau que nous buvons, ainsi que dans le sol et les animaux qui nous entourent. Pour ce faire, ils ont recueilli des données provenant de quatre-vingt-onze études scientifiques publiées au cours des deux dernières décennies. Ils ont soigneusement vérifié les méthodes utilisées dans chaque étude pour garantir la fiabilité des résultats, en se concentre uniquement sur les cas où la bactérie était formellement identifiée par culture en laboratoire plutôt que par des tests moins précis. Leur objectif était de créer une image claire de la prévalence de l'infection et du degré de résistance de la bactérie aux antibiotiques.
Les chercheurs ont découvert que la bactérie est effectivement répandue dans tout le Nigeria, mais qu'elle n'est pas présente de manière égale partout. Lorsqu'ils ont examiné les personnes souffrant de fièvre ou de diarrhée, ils ont trouvé la bactérie chez environ six pour cent d'entre elles. Cependant, la situation était encore plus préoccupante lorsqu'ils ont observé l'environnement. Dans les échantillons prélevés dans des rivières, des puits et des étangs qui n'étaient pas utilisés pour la consommation humaine, la bactérie était présente dans près de quarante pour cent des échantillons. Cela suggère que l'environnement, en particulier les sources d'eau qui ne sont pas strictement destinées à la consommation, agit comme un immense réservoir où la bactérie se cache et se multiplie. L'étude a également révélé que le risque n'est pas le même à travers le pays. Le sud-est du Nigeria présentait les taux d'infection les plus élevés, tandis que le sud-ouest présentait les plus bas. Cette différence reflète probablement les variations de densité de population, d'infrastructures d'assainissement et de gestion de l'eau dans les différentes régions.
L'équipe a également étudié comment la bactérie pénètre dans notre nourriture. Ils ont découvert que les aliments d'origine végétale, tels que les légumes et les fruits, étaient beaucoup plus susceptibles d'être contaminés que les aliments d'origine animale comme la viande ou le lait. Cela se produit parce que ces plantes sont souvent lavées ou irriguées avec de l'eau qui a été polluée par des déchets humains. Bien que les animaux puissent porter d'autres types de salmonelles, cette bactérie spécifique, propre à l'homme, finit généralement sur les plantes en raison de l'eau sale ou d'une mauvaise hygiène de la part des personnes manipulant les aliments. L'étude a noté que même des personnes se sentant parfaitement en bonne santé peuvent porter la bactérie dans leur corps et l'excréter dans leurs déchets sans le savoir. Ces porteurs sains agissent comme des sources d'infection cachées, entretenant le cycle.
La découverte la plus alarmante concerne le niveau de résistance aux médicaments. Les chercheurs ont constaté qu'une grande partie des bactéries étudiées ne pouvait plus être tuée par les antibiotiques courants. Entre vingt-cinq et soixante-quatre pour cent des bactéries étaient résistantes à une classe de médicaments appelés fluoroquinolones, qui inclut des médicaments comme la ciprofloxacine. Plus inquiétant encore, entre trente-six et cinquante-huit pour cent étaient résistantes aux céphalosporines de troisième génération, qui sont souvent utilisées en recours lorsque les autres médicaments échouent. Ce haut niveau de résistance est alimenté par le surdosage de ces médicaments, souvent administrés à des patients sans diagnostic confirmé. Parce que la bactérie est si répandue dans l'environnement et si résistante aux médicaments, les chercheurs soutiennent que s'appuyer uniquement sur les antibiotiques n'est plus une solution durable. Ils suggèrent que l'attention doit se porter sur la prévention de l'entrée de la bactérie dans nos sources d'eau et de nourriture dès le départ, et ils recommandent d'explorer de nouvelles façons de traiter l'infection qui n'impliquent pas les antibiotiques traditionnels, comme l'utilisation d'huiles naturelles ou de vaccins. L'étude conclut que sans améliorations significatives de l'assainissement et sans un changement dans la manière dont nous traitons ces infections, le cycle de la fièvre typhoïde au Nigeria continuera de menacer la santé publique.
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