Turkish Ethnomedicinal Database (TEMDB): A Standardized Dataset of Medicinal Plant Use-Reports in Türkiye
本論文は、トルコにおける37の研究から得られた4,384件の薬用植物利用報告で構成される、標準化されFAIR原則に準拠したデータセットであるトルコ民族薬学的データベース(TEMDB)を紹介するものであり、これは比較分析および将来の研究を促進するために分類学的および治療的データを調和させたものである。
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トルコの隅々、三つの異なる植物学的世界が交差する場所では、古くから地域の景観に依存した深い癒やしの伝統が存在してきました。何世代にもわたり、地域社会は身近な野生植物を頼りにして、病の治療や怪我の手当てを行い、健康を維持してきました。家族を通じて受け継がれ、地元の治癒者によって記録されてきたこの知識は、自然と人間との経験という広大なライブラリを表しています。しかし、歴史的に見ると、この知恵は数百もの個別の研究論文の中に散在していました。それぞれの論文は書き方も異なり、同じ植物に対して異なる名称を用い、治療法についてもさまざまな詳細レベルで記述されています。これらの植物がどのように使われているのかという全体像を理解しようとする科学者や医師にとって、この断片化は重大な障壁となっています。同じ情報が、互いに言葉を通じ合わせることのない別々の未接続のレポートの中に閉じ込められているため、知見を比較したりパターンを見つけ出したりすることが困難なのです。
この問題を解決するために、研究チームは「トルコ民族薬用データベース(Turkish Ethnomedicinal Database)」と呼ばれる新しいデジタルアーカイブを構築しました。このデータベースを、バラバラになった数千のメモを集約し、一つの検索可能なシステムへと統合した、巨大で整理されたファイリングキャビネットと考えてください。研究者たちは、このプロジェクトのために新たに植物を採取に出向いたり、新たな治癒者にインタビューを行ったりしたのではありません。代わりに、彼らは細心の注意を払う司書のように振る舞い、2018年から2020年の間に発表された既存の研究を集めました。彼らは37件の異なる学術論文から生の情報を抽出し、その乱雑で多様な記述を統一された形式へと清浄化したのです。すべての植物が正しい学名によって特定され、報告されたあらゆる疾患が世界中の医師が使用する標準的な医学体系を用いて分類され、そしてあらゆる治療法の調製方法が同一の方法で記述されるように整えました。その結果、トルコのの人々がいかに植物を使用して健康問題に対処してきたかを示す、明確かつ構造化された4,000件以上の具体的な事例の記録が完成し、この伝統的知識を現代的な分析に適した形で利用可能にしたのです。
このデータベース作成への道のりは、主要な科学図書館を用いた系統的な探索から始まりました。研究者たちは、特定の3年間の期間内に、トルコにおける医薬品または動物治療のための植物の使用を文書化した研究を探しました。彼らは厳格な基準を満たす37の研究を見つけ出しました。これらの研究には豊富な情報が含まれていましたが、そのままの形ですぐに使用できる状態ではありませんでした。ある論文では現在使われていない名前で植物を呼んでいる一方で、別の論文では胃痛の治療について説明しており、それが他の論文での消化不良に対する治療と比較するのが難しいといったことが起こり得ます。これを修正するため、チームは植物がある目的で使用されているという報告のひとつひとつを手作業で抽出しました。たとえ二つの異なる研究が同じ植物を同じ疾患のために言及していたとしても、それらを一つにまとめず、情報の出典元とその背景にある独自の物語を保存するために、各報告を独立したエントリーとして保持しました。
生データの収集が終わると、チームは一貫性を持たせるプロセスである「標準化」に着手しました。まず、植物の名前についてです。彼らは世界の植物データベースを使用し、言及されたすべての種について正確な科学的アイデンティティを検証しました。もし研究の中で古い名前や誤った名前が使われていた場合、研究者は正確性のためにオリジナルの名前も記録しましたが、同時に今日においても誰でも正しく識別できるように現在の受理されている学名を付記しました。また、植物を科および属に整理し、明快なタクソノミー(分類学)上の構造を作り上げました。次に、人々がなぜこれらの植物を使用したのかという理由に取り組みました。彼らは、人々の症状や治療に関する何千もの多様な表現を取り上げ、制御された用語リストへとグループ化しました。例えば、ある研究で「膨満感」と言われ、別の研究で「ガス」と言われた場合、研究者たちはこれらを単一の明確なカテゴリーの下に集約しました。
この標準化において極めて重要な部分は、これらの伝統的使用法を、「国際疾病分類(ICD)」――すなわち、疾患を分類するために医療専門家が世界的に使用しているシステム――に紐付けることでした。ヒトの健康記録については、研究者たちは伝統的な用途をこのシステムへとマッピングしました。これは、これらの伝統的な療法が近代医学の意味で証明された治療法であると主張することを意味するのではありません。むしろ、伝統的な症状の記述が標準的な医学的カテゴリーといかに一致するかを、研究者が確認するための架け橋を作ったことを意味します。例えば、「風邪」に対する伝統的な療法は、呼吸器感染症という標準的な医学的カテゴリーに関連付けられる可能性があります。これにより、他の医学データとの容易な比較が可能になります。研究対象に含まれていた動物に関する記録については、人間の医学体系は獣医学のケースには適用できないため、別途用意されたカテゴリセットを使用しました。
現在は第一版となっている最終的なデータベースには、4,384件の個別レコードが含まれています。これらのレコードは、98の植物科と361の属を代表する826種の植物を網羅しています。全レコードの大部分である4,200件以上は、人類の疾患を治療するために植物がどのように用いられているかを記述しており、少数はありますが重要な163件は、動物の治療に植物がどのように用いられているかを記述しています。研究者たちは、特定の植物科が他よりもはるかに頻繁に登場することを発見しました。シソ科(Lamiaceae)が最も多く言及されたグループであり、次いでバラ科、キク科となりました。個別の種においては、イラクサが最も一般的に引用される植物であり、132件の個別報告に現れたほか、それに続いてオオアブラナ(plantain)やノイバラが登場しました。
何を治療しようとしているのかを見たとき、データはある幅広い用途を明らかにしました。最も一般的な標準化された適応症は糖尿病であり、次いで創傷治癒、咳、そして一般的な風邪でした。しかしながら、記録の大部分は、特定の疾患にきれいに収まらない広範なカテゴリーである「一般的な症状および兆候」に分類されました。これは、伝統医学が単なる命名された疾患だけでなく、全身の不快感や特定の症状自体に対処することも多いという事実を浮き彫りにしています。地理的な分布についても偏りが見られました。ドゥズジェ県が最多の報告数を占め、エルールム県、ビンギョル県がそれに続きました。研究者たちは、この偏りが必ずしも国内全体の植物利用の多寡ではなく、元の調査が行われた場所を反映しているものであると指摘しています。
このデータベースの作成は、「FAIR原則」(Findable:発見可能、Accessible:アクセス可能、Interoperable:相互運用可能、Reusable:再利用可能)に基づいて行われました。目標は、このデータを誰もが簡単に見つけられ、不必要な障壁なくアクセスでき、他のデータセットと結合させることができ、再び研究に活用できるようにすることでした。これを達成するため、データベースは公開プラットフォーム上でホストされており、誰でも特定の植物や治療法を検索できるようになっています。ただし、伝統的な慣習の詳細な位置情報が自動化されたシステムによって大量に取得されないよう、全データの一括ダウンロードは制限されています。代わりに、完全なデータセットを必要とする研究者は申請を行う必要があり、これによりデータが責任を持って使用されるようにしています。また、データベースはオープンライセンスであり、原著作者にクレジットを提供することを条件に、誰でも自身の研究にこの情報を利用することができます。
研究者たちは、自らの仕事の限界を定義することにも慎重でした。貴重なフィールドワークの項目であっても、ソースとなる資料が一貫しており査読済みであることを保証するために、大学院の学位論文などは除外しました。また、このデータベースはトルコの民族植物学のすべてを網羅した完全な歴史ではなく、あくまで2018年から2020年の間に発表された研究のスナップショットであることを明確にしました。チームは現場で直接植物を確認したわけでも、レメディ(治療法)が実際に機能するかどうかをテストしたわけでもありません。彼らの役割は、既存の報告を整理・明確化することであり、医学的主張を検証することではないからです。彼らは、元の研究の質にはばらつきがあり、一部の曖壮な点は完全に解決できなかったことも認めています。こうした不確実性は、将来のユーザーが自分たちが目にしているものが何であるかを正確に把握できるよう、文書化されています。
本プロジェクトは、伝統的な知識が管理・共有される手法における大きな前進を象徴しています。分散した報告を一箇所に集め、標準化されたフォーマットにまとめることで、「トルコ民族薬用データベース」は、トルコにおける人と植物の関係についてのより鮮明な視点を提供します。それは将来の研究に向けた基盤となり、科学者が異なる地域間や時期間で知見を比較することを可能にします。データベースは成長するように設計されています。研究者たちは将来的により多くの年度の研究を追加し、より広い時間をカバーするようにアーカイブを拡張していく計画です。現時点において、このデータベースは、情報の整理こそが価値を生むということ、つまり孤立した事実の集合体を、人類の健康における自然の永続的な役割を解明するための首尾一貫したリソースへと変えることができるのだという証左として存在しています。
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